MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori HUP-B14 chromosome

Total Repeats: 29071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017733	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	386745527
2	NC_017733	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	386745527
3	NC_017733	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745527
4	NC_017733	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	386745527
5	NC_017733	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745527
6	NC_017733	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	386745527
7	NC_017733	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	386745527
8	NC_017733	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745527
9	NC_017733	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386745527
10	NC_017733	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	386745527
11	NC_017733	CAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386745528
12	NC_017733	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	386745528
13	NC_017733	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386745528
14	NC_017733	CT	3	6	691	696	0 %	50 %	0 %	50 %	386745528
15	NC_017733	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745528
16	NC_017733	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	386745528
17	NC_017733	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745528
18	NC_017733	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	386745529
19	NC_017733	TCA	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745529
20	NC_017733	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386745529
21	NC_017733	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745529
22	NC_017733	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	386745529
23	NC_017733	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	386745529
24	NC_017733	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745529
25	NC_017733	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	386745529
26	NC_017733	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386745529
27	NC_017733	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386745529
28	NC_017733	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745529
29	NC_017733	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745529
30	NC_017733	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745530
31	NC_017733	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	386745530
32	NC_017733	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	386745530
33	NC_017733	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	386745530
34	NC_017733	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	386745530
35	NC_017733	TTAT	2	8	1856	1863	25 %	75 %	0 %	0 %	386745530
36	NC_017733	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	386745530
37	NC_017733	TTG	2	6	1898	1903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745530
38	NC_017733	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	386745530
39	NC_017733	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745530
40	NC_017733	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745530
41	NC_017733	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745530
42	NC_017733	G	6	6	2189	2194	0 %	0 %	100 %	0 %	386745530
43	NC_017733	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	386745530
44	NC_017733	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	386745530
45	NC_017733	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	386745531
46	NC_017733	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	386745531
47	NC_017733	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	386745531
48	NC_017733	TGA	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745531
49	NC_017733	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	386745531
50	NC_017733	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386745531
51	NC_017733	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	386745531
52	NC_017733	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	386745531
53	NC_017733	GT	3	6	2893	2898	0 %	50 %	50 %	0 %	386745531
54	NC_017733	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	386745531
55	NC_017733	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745531
56	NC_017733	T	6	6	3020	3025	0 %	100 %	0 %	0 %	386745531
57	NC_017733	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745531
58	NC_017733	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386745531
59	NC_017733	TGC	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745532
60	NC_017733	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	386745532
61	NC_017733	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	386745532
62	NC_017733	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	386745532
63	NC_017733	GGT	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745532
64	NC_017733	CTA	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745532
65	NC_017733	AGAA	2	8	3779	3786	75 %	0 %	25 %	0 %	386745532
66	NC_017733	CAG	2	6	3825	3830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386745532
67	NC_017733	ATAG	2	8	3834	3841	50 %	25 %	25 %	0 %	386745532
68	NC_017733	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	386745532
69	NC_017733	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745532
70	NC_017733	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386745532
71	NC_017733	A	7	7	4585	4591	100 %	0 %	0 %	0 %	386745533
72	NC_017733	T	8	8	4605	4612	0 %	100 %	0 %	0 %	386745533
73	NC_017733	AAT	2	6	4626	4631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386745533
74	NC_017733	TAAA	2	8	4694	4701	75 %	25 %	0 %	0 %	386745533
75	NC_017733	A	6	6	4699	4704	100 %	0 %	0 %	0 %	386745533
76	NC_017733	T	6	6	4768	4773	0 %	100 %	0 %	0 %	386745533
77	NC_017733	A	6	6	4782	4787	100 %	0 %	0 %	0 %	386745533
78	NC_017733	TCGC	2	8	5326	5333	0 %	25 %	25 %	50 %	386745534
79	NC_017733	ATTC	2	8	5355	5362	25 %	50 %	0 %	25 %	386745534
80	NC_017733	CATT	2	8	5399	5406	25 %	50 %	0 %	25 %	386745534
81	NC_017733	ATT	2	6	5421	5426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745534
82	NC_017733	C	6	6	5484	5489	0 %	0 %	0 %	100 %	386745534
83	NC_017733	TGG	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745534
84	NC_017733	A	6	6	5595	5600	100 %	0 %	0 %	0 %	386745534
85	NC_017733	A	6	6	5631	5636	100 %	0 %	0 %	0 %	386745534
86	NC_017733	TTG	2	6	5722	5727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745534
87	NC_017733	TTA	2	6	5848	5853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745534
88	NC_017733	GTG	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745534
89	NC_017733	GC	3	6	5979	5984	0 %	0 %	50 %	50 %	386745534
90	NC_017733	CAA	2	6	5985	5990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386745534
91	NC_017733	GTT	2	6	6093	6098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745534
92	NC_017733	AGT	2	6	6146	6151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745534
93	NC_017733	T	6	6	6186	6191	0 %	100 %	0 %	0 %	386745534
94	NC_017733	CGCTTG	2	12	6219	6230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745534
95	NC_017733	CAG	2	6	6266	6271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386745534
96	NC_017733	AC	3	6	6405	6410	50 %	0 %	0 %	50 %	386745534
97	NC_017733	CTT	2	6	6512	6517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745534
98	NC_017733	CGT	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745534
99	NC_017733	TAG	9	27	6539	6565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745534
100	NC_017733	TTA	2	6	6574	6579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745534
101	NC_017733	TGT	2	6	6594	6599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745534
102	NC_017733	GTCGT	2	10	6622	6631	0 %	40 %	40 %	20 %	386745534
103	NC_017733	TTG	2	6	6660	6665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745534
104	NC_017733	GTT	2	6	6729	6734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745534
105	NC_017733	CTGG	2	8	6776	6783	0 %	25 %	50 %	25 %	386745534
106	NC_017733	TTG	2	6	6801	6806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745534
107	NC_017733	CCG	2	6	6863	6868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386745534
108	NC_017733	T	6	6	6911	6916	0 %	100 %	0 %	0 %	386745534
109	NC_017733	ATCG	2	8	6951	6958	25 %	25 %	25 %	25 %	386745534
110	NC_017733	GCT	2	6	6978	6983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745534
111	NC_017733	CGTT	2	8	6986	6993	0 %	50 %	25 %	25 %	386745534
112	NC_017733	GTT	2	6	7008	7013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745534
113	NC_017733	T	6	6	7059	7064	0 %	100 %	0 %	0 %	386745534
114	NC_017733	CAT	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745535
115	NC_017733	GCC	2	6	7505	7510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386745535
116	NC_017733	TCT	2	6	7566	7571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745535
117	NC_017733	GAAACC	2	12	7614	7625	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386745535
118	NC_017733	AAT	2	6	7664	7669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386745535
119	NC_017733	CTT	2	6	7672	7677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745535
120	NC_017733	TTCA	2	8	7742	7749	25 %	50 %	0 %	25 %	386745535
121	NC_017733	CAT	2	6	7762	7767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745535
122	NC_017733	GC	3	6	7809	7814	0 %	0 %	50 %	50 %	386745535
123	NC_017733	ATG	2	6	7815	7820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745535
124	NC_017733	TCA	2	6	7839	7844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745535
125	NC_017733	CG	3	6	7874	7879	0 %	0 %	50 %	50 %	386745535
126	NC_017733	CCG	2	6	7893	7898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386745535
127	NC_017733	CTT	2	6	7912	7917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745535
128	NC_017733	CCG	2	6	7921	7926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386745535
129	NC_017733	T	6	6	7961	7966	0 %	100 %	0 %	0 %	386745535
130	NC_017733	TCGC	2	8	7983	7990	0 %	25 %	25 %	50 %	386745535
131	NC_017733	AG	3	6	8021	8026	50 %	0 %	50 %	0 %	386745535
132	NC_017733	TCTT	2	8	8036	8043	0 %	75 %	0 %	25 %	386745535
133	NC_017733	CAT	2	6	8116	8121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745535
134	NC_017733	GTG	2	6	8148	8153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745535
135	NC_017733	TTC	2	6	8228	8233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745535
136	NC_017733	TGA	2	6	8236	8241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745535
137	NC_017733	CCG	2	6	8247	8252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386745535
138	NC_017733	TTTCT	2	10	8278	8287	0 %	80 %	0 %	20 %	386745535
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